Elektroforeza gel dikare di orîjînalek an jî vertîkal de were meşandin. Geliyên horizontî bi gelemperî ji matrixek agarose pêk tê. Mezinahiyên pora van gêlan bi giraniya pêkhateyên kîmyewî ve girêdayî ye: porên gêla agarose (100 heta 500 nm diameter) li gorî ya gelporên acrylamide (bi dirêjahiya 10 heta 200 nm) mezintir û kêmtir yekreng in. Bi berawirdî, molekulên ADN û ARNyê ji rêzikek xêzikî ya proteînê mezintir in, ku bi gelemperî berî, an di dema vê pêvajoyê de têne denaturîzekirin, analîzkirina wan hêsantir dike. Ji ber vê yekê, molekulên ADN û RNA pir caran li ser gêlên agarose (horizontal) têne xebitandin. Ev amûra avêtina gêlê ya çêkirî dikare 4 mezinahiyên cûrbecûr jelê bi tepsiyên gêlê yên cihêreng çêbike.
